大明万历年间，江南某地治安混乱、匪患猖獗。当地盗贼首领“苏先生”被当地官府追查多年，却未发现丝毫线索，行踪神秘。新任知府左宗元为给在京城任御史的岳父庆贺生辰，委托威武镖局总镖头马一刀押送价值连城的

　　世代研究医术的神木族少年木星尘，救下误闯领地的医药世家之女叶云裳，为逃避皇族内斗而随她一起来到民国乱世，却遇上罕见瘟疫，木星尘凭借青囊术拯救了众生和本族，经历各类诱惑与爱情的考验，最终成为一代医尊