进入了明治时代，曾经的“刽子手拔刀斋”绯村剑心（佐藤健 饰）已经习惯了神谷道场的安宁生活。谁知就在这一天，倒幕战争时的旧友——号称维新三杰之一的大久保利通（宫泽和史 饰）将其请去。原来继承了剑心刽

　　明治维新运动后十二年，日本迎来了新时代。曾经叱咤风云的刽子手绯村剑心如今已成为和平主义者，与朋友们一起在东京过着平静的生活。一天晚上，剑心最喜欢的餐厅遭到炮火袭击，只留下一张写着“人诛”的字条——

　　幕府时代末期，外忧内患，山河动荡，百姓生活困苦，且生命时刻受到威胁。少年心太因其善良纯洁之心感动飞天御剑流高手比古清十郎，被其收入门下学习剑法，更名剑心。　　在国家危难之际，年轻的剑心怀揣改变时代

　　经历了动荡的明治维新，日本迎来新的时代。在明治政府第十个年头，不祥的气息弥漫东京。恶德实业家武田观柳（香川照之 饰）操纵女医师高荷惠（苍井优 饰）研制新型鸦片，公开招揽落魄武夫，大肆收购周边土地，

　　为了救神谷薰（武井咲 饰），绯村剑心（佐藤健 饰）纵身跃入大海，昏迷中他飘到某座小岛，最终为传授了他飞天御剑流的师父比古清十郎（福山雅治 饰）所救。深感到自身与志志雄真实（藤原龙也 饰）的巨大差距

　　今野秋一（绫野刚 饰演）因为被公司调职，从大城市的东京来到岩手县盛冈市居住，人生地不熟的他，虽能与同事正常相处却总无法融入。直到他结识了同龄的日浅典博（松田龙平 饰演），才逐渐对这未知的土地卸下了

　　大雨瓢泼的都市，邪恶欲望肆意横行。不经意间残忍而血腥的猎奇案件接连发生，有的人被饿犬撕咬而死，有的人被割掉和出生时同样重量的肉而死掉，有的被平均切成两半分送给妻子与情人，有的则被冻在冰柜中永葆不老

　　近未来，科学家研发出可以窥探人类脑中世界的MRI扫描器。借助该扫描仪的帮助，警方可以从死者临终前看到的影像中追查线索。名为科学警察研究所法医第九研究室的机关，正是运用MRI扫描技术的经营机关。作为

　　桐山零（神木隆之介 饰）是将棋界公认的天才，年仅17岁的他便已经成为了一名职业棋手，在棋盘上打败了无数年长与他许多的对手。实际上，零拥有着悲惨的过去，他的家人们很早之前在一场可怕的车祸中全部去世了

　　未来世界，秘密系统“白金数据”得到开发，日本全国人民的DNA数据被存储其中，进而借此构建了一个检举率100%、冤案率0%的理想社会。可即便如此尖端的系统，也被代号为“NF13”的连环杀人案所难住，